Özet : Üç kişilik Türk Özel Kuvvetler Timi, Suriye’nin El Bab Bölgesinde, özel bir operasyon sırasında şehit düşmüştür. Şehitlerin cenazesini teröristler ele geçirmek istemektedir. Ancak Türkiye üç şehidini geride bırakmamakta kararlıdır. Bunun için şehitleri vatana geri getirme görevi Binbaşı Tuna Alkan ve üç askerine verilir. Ancak Suriye çok karışıktır ve pek çok terör örgütü ya da farklı ülke çıkar çatışması halindedir. Türk Silahlı Kuvvetleri belli bir noktaya kadar kurtarma görevine giden askerlerine destek verebilmektedir. Ancak ne olursa olsun üç şehidin cenazesi vatana geri getirilmelidir. Operasyon sırasında birçok tehlike atlatan, iç savaş ve savaşın ne olduğunu an be an gören Binbaşı Tuna Alkan ve askerleri, her adımlarında ölüme gitmektedirler. Kurtarma operasyonunda askerler, sık sık görevleri ve vicdanları arasında kalacaklardır. Her türlü tehdidin bulunduğu Suriye’nin El Bab bölgesinde üç şehidin cenazesi için çıkılan yolda, Binbaşı Tuna Alkan ve askerleri türlü zorluklar ve yıkımlarla karşılaşırlar. Binbaşı Tuna Alkan ve askerlerine verilen görev üç şehidi vatan topraklarına getirmektir ancak bu görev bir süre sonra bambaşka bir mücadeleye dönecektir. Gerçek ve yaşanmış bir hikaye den yola çıkılarak hazırlanan Komutan Filminde anlatılanlar terörle mücadele sırasında şehit olmuş askerlerin yaşadığının küçük bir bölümüdür.